品系基本信息
特性和(hé)用(yòng)途
多(duō)基因片段快(kuài)速拼接克隆試劑盒
産品組成:
組成 | 貨号 | VK009-10T | VK009-30T | |
Easy Assembly Mix(Mix) | Easy assembly 酶與反應 buffer 混合物(wù);7.5μL/管 | VK009-1 | 10 管 | 30 管 |
Positive control(PC) | 陽性連接 DNA 片段和(hé)載體混合物(wù)(10μL) | VK009-2 |
注意:收到試劑盒後,使用(yòng)前請離心,避免液體滞留在離心管蓋、管壁上。
保存條件:-80℃ 保存一年;或 -20℃ 保存兩個(gè)月(yuè)。請将産品于 -80℃ 保存,避免反複凍融。
Easy Assembly反應示意圖:
Easy Assembly 通(tōng)過體外重組方法一步完成多(duō)個(gè)(2-6 個(gè)) DNA 片段無縫拼接連接(見下(xià)圖)。Easy Assembly 是一種新穎的(de)分(fēn)子克隆方法,不需要傳統克隆方式的(de)酶切連接,僅需要 15-70bp(建議(yì) 50bp)的(de)同源接頭,并可(kě)以随意修改接頭部位的(de)序列,使得(de) DNA 克隆方便
快(kuài)捷,連接更加精确,且反應時(shí)間短。
Easy Assembly 的(de)優勢:
1/ 實現多(duō)個(gè) DNA 片段同時(shí)拼接
2/ 拼接 DNA 片段大(dà)小範圍寬(260bp-10Kbp),實現大(dà)片段 DNA 的(de)克隆
3/ 試驗操作簡單,避免了(le) DNA 酶切、回收、連接等分(fēn)子克隆操作,操作時(shí)間大(dà)大(dà)縮短,約半小時(shí)可(kě)完成反應
4/ 反應效率高(gāo)
适用(yòng)範圍:
1/ 載體≤15k; 連接片段長(cháng)度 260bp-10Kbp; 連接 DNA 片段數目≤10
2/ 接頭長(cháng)度:15-70bp, 40-50bp 最佳
3/ DNA 片段推薦濃度:0.002-0.010pmol/片段
4/ 濃度計算(suàn):pmol=DNA 質量(ng)×1000/(堿基對(duì)數目×650D)。例如,50ng 5kb 的(de)雙鏈 DNA 爲 0.015pmol
實驗步驟:
1/ 分(fēn)别通(tōng)過 PCR 或者酶切準備進行拼接的(de) DNA 片段,定量。
2/ 取一支 easy Assembly mix 離心,避免液體殘餘管蓋、管壁上,放置在冰上。
3/ 将各個(gè) DNA 片段按等摩爾量混合,取總量 2.5μl 的(de) DNA 片段,加入到一支 easy Assembly mix 管中,混勻。
4/ 立即置于 50℃(可(kě)在 PCR 儀上進行),反應 30min-60min 後,然後進行 DNA 的(de) E.coli 轉化(huà),複蘇,塗闆。
注意事項:
1/ 加入的(de) DNA 片段應爲等摩爾量。
2/ 加樣過程于 4℃ 操作。
3/ 當出現下(xià)列情況建議(yì)使用(yòng) 2 倍反應體系:連接 DNA 片段多(duō)于 5 段,或者單片段長(cháng)度大(dà)于 6k, 接頭長(cháng)度小于 15bp 或大(dà)于 50bp, 反應片段摩爾量低于 0.0002pmol.
4/ 若接頭大(dà)于 70bp, 建議(yì)适當延長(cháng)反應時(shí)間。
5/ 多(duō)片段反應時(shí),接頭應避免出現重複序列,或者拼接片段中除接頭外盡量不要再有接頭序列,由于反應原理(lǐ)是體外同源重組,将可(kě)能出現這(zhè)些同源序列的(de)意外拼接。
6/ 建議(yì)使用(yòng) DH5α 感受态細胞進行轉化(huà)。
7/ 建議(yì)轉化(huà)後複蘇 45min-1h.
同源接頭設計例子:
下(xià)面序列是需要拼接的(de)相鄰 DNA 序列,分(fēn)别用(yòng)紅色字體與黑(hēi)色字體标示。所以接頭的(de)同源序列就直接取紅色與黑(hēi)色字體的(de)交接處的(de) DNA 序列:
GCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTCTACCACCACTCTGTGGCACTTTCCAATTTCAGACTCTGATCCGGACACT
CTTACAGGGNNNNNNNATGCTGGAGAAGTTCTGCAACTCTACTTTTTGGAATTCCTCATTCCTGGACAGTCCGGAGGCAGACCTGCCACTTTGTTTT
GAGCAAACTGTTCTGGTGTGGATTCCCTTGGGCTTCCTATGGCTCCTGGCCCCCTGGCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTC
TACCACCAAACTCTATCTTGCTAAGCAGGTATTCGTTGGTTTTCTTCTTATTCTAGCAGCCATAGAGCTGGCCCTTGTACTCACAGAAGACTCTGGAC
AAGCCACAGTCCCTGCTGTTCGANNNNNNNNNNTGATCTTTTCAGCATTTTCAGAAAATAATGAGT
CATCAAATAATCCATCA
因此,接頭同源序列可(kě)以加在引物(wù)上,如下(xià):
片段 1 正向引物(wù):根據上一段拼接的(de)序列而定
片段 1 反向引物(wù):
TGGTGGTAGAGGATCTCTTGGTCCTGGATTTATACACGTGGAGAAGCTGC
片段 2 正向引物(wù):
GCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTCTACCACCA
片段 2 反向引物(wù):根據下(xià)一段拼接的(de)序列而定
片段 1 和(hé)片段 2 的(de) PCR 産物(wù),再加上其他(tā) DNA 片段将可(kě)以通(tōng)過 Easy Assembly Cloning Kit 無縫拼接在一起了(le)。
驗證數據
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