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品系基本信息

多(duō)基因片段快(kuài)速拼接克隆試劑盒

特性和(hé)用(yòng)途

多(duō)基因片段快(kuài)速拼接克隆試劑盒

 

産品組成:


組成

貨号

VK009-10T

VK009-30T

Easy Assembly Mix(Mix)

Easy assembly 酶與反應 buffer 混合物(wù);7.5μL/

VK009-1

10

30

Positive control(PC)

陽性連接 DNA 片段和(hé)載體混合物(wù)(10μL)

VK009-2



注意:收到試劑盒後,使用(yòng)前請離心,避免液體滞留在離心管蓋、管壁上。

 

保存條件:-80℃ 保存一年;或 -20℃ 保存兩個(gè)月(yuè)。請将産品于 -80℃ 保存,避免反複凍融。

 

Easy Assembly反應示意圖:

Easy Assembly 通(tōng)過體外重組方法一步完成多(duō)個(gè)(2-6 個(gè)) DNA 片段無縫拼接連接(見下(xià)圖)Easy Assembly 是一種新穎的(de)分(fēn)子克隆方法,不需要傳統克隆方式的(de)酶切連接,僅需要 15-70bp(建議(yì) 50bp)的(de)同源接頭,并可(kě)以随意修改接頭部位的(de)序列,使得(de) DNA 克隆方便

快(kuài)捷,連接更加精确,且反應時(shí)間短。

Easy Assembly 的(de)優勢:

1/ 實現多(duō)個(gè) DNA 片段同時(shí)拼接

2/ 拼接 DNA 片段大(dà)小範圍寬(260bp-10Kbp),實現大(dà)片段 DNA 的(de)克隆

3/ 試驗操作簡單,避免了(le) DNA 酶切、回收、連接等分(fēn)子克隆操作,操作時(shí)間大(dà)大(dà)縮短,約半小時(shí)可(kě)完成反應

4/ 反應效率高(gāo)

 

适用(yòng)範圍:

1/ 載體≤15k; 連接片段長(cháng)度 260bp-10Kbp; 連接 DNA 片段數目≤10

2/ 接頭長(cháng)度:15-70bp, 40-50bp 最佳

3/ DNA 片段推薦濃度:0.002-0.010pmol/片段

4/ 濃度計算(suàn):pmol=DNA 質量(ng)×1000/(堿基對(duì)數目×650D)。例如,50ng 5kb 的(de)雙鏈 DNA 0.015pmol

 

實驗步驟:

1/ 分(fēn)别通(tōng)過 PCR 或者酶切準備進行拼接的(de) DNA 片段,定量。

2/ 取一支 easy Assembly mix 離心,避免液體殘餘管蓋、管壁上,放置在冰上。

3/ 将各個(gè) DNA 片段按等摩爾量混合,取總量 2.5μl 的(de) DNA 片段,加入到一支 easy Assembly mix 管中,混勻。

4/ 立即置于 50℃(可(kě)在 PCR 儀上進行),反應 30min-60min 後,然後進行 DNA 的(de) E.coli 轉化(huà),複蘇,塗闆。

 

注意事項:

1/ 加入的(de) DNA 片段應爲等摩爾量。

2/ 加樣過程于 4℃ 操作。

3/ 當出現下(xià)列情況建議(yì)使用(yòng) 2 倍反應體系:連接 DNA 片段多(duō)于 5 段,或者單片段長(cháng)度大(dà)于 6k, 接頭長(cháng)度小于 15bp 或大(dà)于 50bp, 反應片段摩爾量低于 0.0002pmol.

4/ 若接頭大(dà)于 70bp, 建議(yì)适當延長(cháng)反應時(shí)間。

5/ 多(duō)片段反應時(shí),接頭應避免出現重複序列,或者拼接片段中除接頭外盡量不要再有接頭序列,由于反應原理(lǐ)是體外同源重組,将可(kě)能出現這(zhè)些同源序列的(de)意外拼接。

6/ 建議(yì)使用(yòng) DH5α 感受态細胞進行轉化(huà)。

7/ 建議(yì)轉化(huà)後複蘇 45min-1h.

 

同源接頭設計例子:

下(xià)面序列是需要拼接的(de)相鄰 DNA 序列,分(fēn)别用(yòng)紅色字體與黑(hēi)色字體标示。所以接頭的(de)同源序列就直接取紅色與黑(hēi)色字體的(de)交接處的(de) DNA 序列:

GCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTCTACCACCACTCTGTGGCACTTTCCAATTTCAGACTCTGATCCGGACACT

CTTACAGGGNNNNNNNATGCTGGAGAAGTTCTGCAACTCTACTTTTTGGAATTCCTCATTCCTGGACAGTCCGGAGGCAGACCTGCCACTTTGTTTT

GAGCAAACTGTTCTGGTGTGGATTCCCTTGGGCTTCCTATGGCTCCTGGCCCCCTGGCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTC

TACCACCAAACTCTATCTTGCTAAGCAGGTATTCGTTGGTTTTCTTCTTATTCTAGCAGCCATAGAGCTGGCCCTTGTACTCACAGAAGACTCTGGAC

AAGCCACAGTCCCTGCTGTTCGANNNNNNNNNNTGATCTTTTCAGCATTTTCAGAAAATAATGAGT

CATCAAATAATCCATCA

 

因此,接頭同源序列可(kě)以加在引物(wù)上,如下(xià):

片段 1 正向引物(wù):根據上一段拼接的(de)序列而定

片段 1 反向引物(wù):

TGGTGGTAGAGGATCTCTTGGTCCTGGATTTATACACGTGGAGAAGCTGC

 

片段 2 正向引物(wù):

GCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTCTACCACCA

片段 2 反向引物(wù):根據下(xià)一段拼接的(de)序列而定

片段 1 和(hé)片段 2 的(de) PCR 産物(wù),再加上其他(tā) DNA 片段将可(kě)以通(tōng)過 Easy Assembly Cloning Kit 無縫拼接在一起了(le)。

 

 

 

 

 


驗證數據

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