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品系基本信息

TALEN 質粒設計與構建

特性和(hé)用(yòng)途

TALEN質粒設計與構建


TALEN靶向敲除基因原理(lǐ)簡介

       TALE技術(Transcription activator-like effectors)是一種嶄新的(de)分(fēn)子生物(wù)學工具。科學家發現,來(lái)自植物(wù)細菌Xanthomonassp的(de)TAL蛋白的(de)核酸結合域的(de)氨基酸序列與其靶位點的(de)核酸序列有恒定的(de)對(duì)應關系。利用(yòng)TAL的(de)序列模塊,可(kě)組裝成特異結合任意DNA序列的(de)模塊化(huà)蛋白。TALEN(Transcription activator-like effector(TAL) nucleases)技術是基于TALE與人(rén)工改造的(de)核酸内切酶的(de)切割域(FokI)構建針對(duì)任意特定核酸靶序列的(de)重組核酸酶。通(tōng)過TAL的(de)DNA識别域結合到靶位點上,及FokI切割域形成二聚體後,可(kě)特異性對(duì)目标DNA序列實現切斷。在随後的(de)非同源末端連接修複過程中,斷開的(de)DNA雙鏈會由于堿基的(de)随機增減從而以一定的(de)概率實現目标基因功能的(de)缺失。



    

       将識别特異DNA序列的(de)TALE與内切核酸酶FokI偶聯,可(kě)構建成剪切特異DNA序列的(de)内切酶TALEN。而且FokI需形成二聚體方能發揮活性,大(dà)大(dà)減少了(le)随意剪切的(de)幾率。在實際操作中,需在目标基因的(de)編碼區(qū)或外顯子和(hé)内顯子的(de)交界處選擇兩處相鄰(間隔13-22堿基)的(de)靶序列(一般16-20個(gè)堿基)分(fēn)别進行TALE識别模塊構建。将這(zhè)兩個(gè)相鄰靶點識别模塊(分(fēn)别)融合克隆到FokI的(de)N-末端,形成真核表達載體,得(de)到TALEN質粒對(duì)。









       将TALEN質粒對(duì)共轉入細胞中可(kě)實現靶基因敲除。TALEN質粒對(duì)共轉入細胞後,表達的(de)融合蛋白,分(fēn)别與靶位點特異結合,由于兩個(gè)TALEN融合蛋白中的(de)FokI臨近,形成二聚體,發揮非特異性内切酶活性,在兩個(gè)靶位點之間剪切DNA,形成DSB(Double-Strand Breaks),誘發DNA損傷修複機制。細胞可(kě)以通(tōng)過NHEJ(Non-homologous End Joining)修複DNA,在此修過程中或多(duō)或少地删除或插入了(le)一定數目的(de)堿基,造成移碼,形成目标基因敲除突變體。

服務内容

 TALEN質粒構建全套解決方案


步驟

服務内容

配套産品

明(míng)确物(wù)種和(hé)載體

不同物(wù)種不同載體,清單請詳見:Talen(增強型)打靶質粒構建試劑盒


設計靶點

一般在不同轉錄産物(wù)的(de)共同外顯子上設計3-5個(gè)靶點,靶點位置盡量在基因CDS的(de)前1/3,ATG之後,不在最後一個(gè)exon上,最好能破壞重要的(de)domain和(hé)所有的(de)轉錄産物(wù)isoform。


合成

合成前請檢測靶點是否存在SNP

e-TALEN構建試劑盒

靶點切割活性檢測

293T細胞内檢測SSA活性

SSA活性報道質粒構建試劑盒

内源活性驗證(有條件選擇)

若目的(de)細胞轉染效率高(gāo),如293T細胞,可(kě)轉染72h後提基因組,擴增靶序列,T7E1酶切驗證,進一步測序驗證。

T7E1酶

雙元載體連接(有條件選擇)

連接到植物(wù)或釀酒酵母的(de)雙元載體上

植物(wù)雙元載體、釀酒酵母雙元載體



驗證數據

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