Technology
唯尚立德

01.

哺乳動物(wù)動物(wù)卵母細胞的(de)較小染色體爲何容易發生分(fēn)離錯誤?

卵母細胞減數分(fēn)裂過程中的(de)染色體分(fēn)離錯誤會導緻卵子非整倍體(aneuploidy)。這(zhè)種錯誤發生的(de)頻(pín)率随著(zhe)母體年齡的(de)增加而增加。體細胞中較大(dà)的(de)染色體更容易發生分(fēn)離錯誤,而衰老的(de)卵母細胞則不同,它更傾向于在較小的(de)染色體上發生分(fēn)離錯誤。卵子中較小染色體非整倍體是導緻流産和(hé)先天性疾病(如唐氏綜合征)的(de)主要原因。較小的(de)染色體是如何在衰老的(de)卵母細胞中優先發生分(fēn)離錯誤的(de),目前尚不清楚。

在一項新的(de)研究中,爲了(le)研究單個(gè)染色體的(de)動态變化(huà),來(lái)自日本理(lǐ)化(huà)學研究所生物(wù)系統動力學研究中心的(de)研究人(rén)員(yuán)開發了(le)一套全面的(de)熒光(guāng)探針,可(kě)特異性标記小鼠 20 條染色體(19 條常染色體和(hé)一條X 染色體)中的(de)每一條。利用(yòng)這(zhè)些探針,他(tā)們建立了(le)一個(gè)實時(shí)成像管道,可(kě)在小鼠卵母細胞減數分(fēn)裂過程中對(duì)已識别的(de)染色體進行完整的(de)三維跟蹤。通(tōng)過這(zhè)一“染色體識别與跟蹤(chromosome identifying-and-tracking)”管道,他(tā)們從 93 個(gè)卵母細胞中獲取了(le)九條不同的(de)已識别染色體及其著(zhe)絲粒的(de) 217 條完整的(de)三維軌迹。利用(yòng)這(zhè)一全面的(de)數據集,他(tā)們旨在定量分(fēn)析基于染色體大(dà)小的(de)時(shí)空動态,并檢驗它們是否會導緻較小染色體的(de)優先分(fēn)離錯誤。相關研究結果發表在2024年7月(yuè)19日的(de)Science期刊上,論文标題爲“Live chromosome identifying and tracking reveals size-based spatial pathway of meiotic errors in oocytes”。

他(tā)們的(de)定量分(fēn)析發現,盡管每條染色體在卵母細胞中的(de)動态表現出很大(dà)的(de)差異性,但較小的(de)染色體在減數分(fēn)裂的(de)前中期(prometaphase)更傾向于向紡錘體赤道的(de)内部區(qū)域移動。在小鼠和(hé)人(rén)類卵母細胞中,對(duì)較小染色體的(de)這(zhè)種偏好導緻建立了(le)一種基于染色體大(dà)小的(de)空間排列,即較小染色體優先位于中期闆(metaphase plate)的(de)内側區(qū)域。卵母細胞可(kě)以建立這(zhè)種基于染色體大(dà)小的(de)空間排列,而不需要預先存在染色體定位偏差,這(zhè)表明(míng)存在一種主動建立這(zhè)種空間排列的(de)前中期途徑。這(zhè)些作者發現,較小的(de)染色體傾向于更早地伸展,而且這(zhè)種伸展與較小染色體的(de)向内運動結合得(de)更緊密,這(zhè)表明(míng)這(zhè)種前中期途徑涉及較小染色體上更早的(de)雙極微管附著(zhe)。這(zhè)種前中期途徑的(de)活躍與年齡無關。

對(duì)老齡小鼠卵母細胞的(de)染色體追蹤顯示,染色體過早分(fēn)離主要發生在中期闆的(de)内部區(qū)域,這(zhè)是由于衰老導緻染色體内聚力降低,也(yě)是造成分(fēn)離錯誤的(de)主要原因。染色體的(de)過早分(fēn)離取決于雙極微管的(de)拉力,而這(zhè)些作者發現,在著(zhe)絲粒-著(zhe)絲點(kinetochore-centromere)距離增加的(de)情況下(xià),中期闆内部區(qū)域中的(de)雙極微管拉力明(míng)顯更強。用(yòng)人(rén)造珠子防止較小染色體在内部定位,可(kě)顯著抑制衰老的(de)卵母細胞在較長(cháng)的(de)減數分(fēn)裂中期過早發生染色體分(fēn)離,這(zhè)表明(míng)較小染色體優先在内部定位是衰老的(de)卵母細胞發生分(fēn)離錯誤的(de)風險之一。

02.

新研究發現在母鼠與幼鼠互動時(shí),幼鼠大(dà)腦(nǎo)未定區(qū)中的(de)神經元變得(de)更加活躍

在一項新的(de)研究中,來(lái)自耶魯大(dà)學和(hé)索邦大(dà)學的(de)研究人(rén)員(yuán)将光(guāng)纖探針(fiber-optic probe)植入小鼠幼崽的(de)大(dà)腦(nǎo)中,以進一步了(le)解在幼崽與其母體的(de)早期社會互動過程中會發生什(shén)麽,從而導緻母子紐帶的(de)建立。他(tā)們發現當母鼠與幼鼠互動時(shí),小鼠大(dà)腦(nǎo)的(de)一部分(fēn)會變得(de)更加活躍。相關研究結果發表在2024年7月(yuè)26日的(de)Science期刊上,論文标題爲“Neurons for infant social behaviors in the mouse zona incerta”。
先前的(de)研究表明(míng),許多(duō)動物(wù)的(de)母親和(hé)它們的(de)後代之間建立了(le)牢固的(de)紐帶---這(zhè)種紐帶促使母親教後代如何生存,并保護它們不受傷害。它還(hái)促使後代将母親視爲生存的(de)源泉。但是,人(rén)們對(duì)誘發這(zhè)種紐帶的(de)大(dà)腦(nǎo)發生了(le)什(shén)麽知之甚少。在這(zhè)項新的(de)研究中,研究者确定了(le)大(dà)腦(nǎo)的(de)哪些部分(fēn)參與了(le)這(zhè)種紐帶,以及在這(zhè)種紐帶發生中這(zhè)些大(dà)腦(nǎo)部分(fēn)發生了(le)什(shén)麽變化(huà)。

研究者在先前研究---表明(míng)母親和(hé)子女(nǚ)之間的(de)聯系可(kě)能起源于未定區(qū)(zona incerta),即位于丘腦(nǎo)下(xià)部的(de)一小塊灰質---的(de)基礎上開始了(le)他(tā)們的(de)研究。先前的(de)研究表明(míng),嬰兒(ér)大(dà)腦(nǎo)中這(zhè)個(gè)區(qū)域的(de)神經元向大(dà)腦(nǎo)的(de)其他(tā)部分(fēn)發送信号,幫助調節生長(cháng)。
爲了(le)進一步了(le)解這(zhè)種活動,研究者植入了(le)光(guāng)纖探針,以監測神經放電。他(tā)們還(hái)采集了(le)大(dà)腦(nǎo)樣本,發現未定區(qū)中的(de)神經元能表達一種叫做(zuò)生長(cháng)抑素(somatostatin)的(de)激素,已知這(zhè)種激素能阻止皮質酮等其他(tā)激素的(de)釋放,從而調節多(duō)種身體機能。
研究者随後研究了(le)在小鼠幼崽進行包括哺乳在内的(de)各種活動時(shí)未定區(qū)的(de)行爲。他(tā)們發現,當幼崽接受母鼠哺乳時(shí),大(dà)腦(nǎo)這(zhè)一部分(fēn)的(de)神經元會變得(de)更加活躍。當幼崽遇到其他(tā)哺乳母鼠時(shí),這(zhè)些神經元也(yě)會變得(de)更加活躍,不過活躍程度沒有那麽高(gāo)。
03.

新研究揭示表觀遺傳學如何影(yǐng)響哺乳動物(wù)記憶形成

當我們形成新的(de)記憶時(shí),大(dà)腦(nǎo)會發生物(wù)理(lǐ)和(hé)功能上的(de)變化(huà),統稱爲“記憶痕迹(memory trace)”。記憶痕迹代表了(le)特定活動模式和(hé)神經元的(de)結構變化(huà),這(zhè)些變化(huà)發生在記憶形成和(hé)後來(lái)的(de)回憶中。但是,大(dà)腦(nǎo)如何“決定”哪些神經元将參與記憶痕迹呢(ne)?現有研究表明(míng)神經元固有的(de)興奮性在其中發揮了(le)作用(yòng),但目前公認的(de)學習(xí)觀點卻忽視了(le)對(duì)神經元本身的(de)指揮中心——細胞核的(de)研究。在細胞核中,似乎存在著(zhe)另一個(gè)未被探索的(de)層面:表觀遺傳學。
在特定有機體的(de)每個(gè)細胞内,DNA 所編碼的(de)遺傳物(wù)質都是相同的(de),但組成人(rén)體的(de)各種細胞類型,如皮膚細胞、腎細胞或神經細胞,卻各自表達著(zhe)一組不同的(de)基因。表觀遺傳學就是研究細胞如何在不改變 DNA 序列的(de)情況下(xià)控制這(zhè)些基因活性的(de)機制。

如今,在一項新的(de)研究中,洛桑聯邦理(lǐ)工學院神經科學家Johannes Gräff及其團隊探索了(le)表觀遺傳學是否會影(yǐng)響神經元被選中形成記憶的(de)可(kě)能性。他(tā)們的(de)小鼠研究結果表明(míng),神經元的(de)表觀遺傳狀态是它在記憶編碼中發揮作用(yòng)的(de)關鍵。相關研究結果發表在2024年7月(yuè)26日的(de)Science期刊上,論文标題爲“Chromatin plasticity predetermines neuronal eligibility for memory trace formation”。
Gräff和(hé)他(tā)的(de)團隊想知道表觀遺傳因素是否會影(yǐng)響神經元的(de)“記憶”功能。當神經元細胞核内的(de)DNA松散或松弛時(shí),神經元在表觀遺傳學上是開放的(de);而當DNA緊湊緊密時(shí),神經元在表觀遺傳學上是閉合的(de)。Gräff說,“我們從以DNA爲中心的(de)層面揭示了(le)記憶形成的(de)最初步驟。”
他(tā)們發現,開放的(de)神經元更有可(kě)能被招募到“記憶痕迹”中。“記憶痕迹”是大(dà)腦(nǎo)中神經元的(de)稀疏集合,它們在學習(xí)新知識時(shí)會顯示出電活動。事實上,處于更開放染色質狀态的(de)神經元也(yě)表現出更高(gāo)的(de)電活動。
随後,這(zhè)些作者利用(yòng)病毒遞送表觀遺傳酶,從而人(rén)爲誘導神經元的(de)開放性。他(tā)們發現,相應的(de)小鼠學習(xí)效果更好。當他(tā)們使用(yòng)相反的(de)方法閉合神經元的(de)DNA時(shí),這(zhè)些小鼠的(de)學習(xí)能力就被取消了(le)。這(zhè)些發現爲理(lǐ)解神經元細胞核編碼的(de)學習(xí)開辟了(le)新的(de)途徑,甚至有朝一日可(kě)能會開發出改善學習(xí)的(de)藥物(wù)。


04.

利用(yòng)人(rén)類線粒體mRNA結構組揭示人(rén)類線粒體中的(de)基因表達機制

來(lái)自邁阿密大(dà)學和(hé)哈佛醫學院的(de)研究人(rén)員(yuán)在一項新的(de)研究中改進了(le)一種利用(yòng)硫酸二甲酯(DMS)對(duì) mRNA 結構進行化(huà)學探測的(de)方法,其中硫酸二甲酯可(kě)将腺嘌呤和(hé)胞嘧啶未配對(duì)且可(kě)觸及的(de)堿基配對(duì)面甲基化(huà)。
人(rén)類線粒體基因組(mtDNA)的(de)表達爲催化(huà)有氧能量轉移并維持生命的(de)氧化(huà)磷酸化(huà)(oxidative phosphorylation)酶複合物(wù)提供了(le) 13 個(gè)重要的(de)蛋白亞基。人(rén)類mtDNA 是一個(gè) 16.569Kb 的(de)雙鏈分(fēn)子,有重鏈(H)和(hé)互補的(de)輕鏈(L)。人(rén)類mtDNA的(de)轉錄幾乎橫跨其整個(gè)長(cháng)度,産生兩個(gè)長(cháng)的(de)多(duō)順反子轉錄本(polycistronic transcript),這(zhè)兩個(gè)多(duō)順反子轉錄本經過處理(lǐ)後産生 11 個(gè)成熟的(de) mRNA,此外仍有兩個(gè)轉錄單位仍未經過處理(lǐ),以雙順反子元件形式存在,包含重疊的(de)和(hé)-1 移位的(de)開放閱讀框(ORF),用(yòng)以編碼 ATP8 和(hé) ATP6 或 ND4L 和(hé) ND4。人(rén)類mtDNA還(hái)編碼線粒體核糖體中合成這(zhè)些蛋白所需的(de)兩種核糖體 RNA(12S rRNA和(hé) 16S rRNA)和(hé) 22 種轉移 RNA(tRNA)。
在過去的(de)五十年中,有關 mtDNA 轉錄和(hé)線粒體信使 RNA(mt-mRNA)穩定性、加工、修飾和(hé)翻譯的(de)分(fēn)子機制已逐漸被描述出來(lái),并且仍然是研究的(de)熱(rè)點。然而,科學家們對(duì) mt-mRNA 折疊結構組(structurome)的(de)了(le)解非常有限,這(zhè)阻礙了(le)人(rén)們對(duì) mtDNA 基因表達及其調控的(de)機理(lǐ)了(le)解。

獲取完整線粒體内的(de) mRNA 結構數據對(duì)于了(le)解其生物(wù)背景至關重要。爲此,來(lái)自邁阿密大(dà)學和(hé)哈佛醫學院的(de)研究人(rén)員(yuán)在一項新的(de)研究中改進了(le)一種利用(yòng)硫酸二甲酯(DMS)對(duì) mRNA 結構進行化(huà)學探測的(de)方法,其中硫酸二甲酯可(kě)将腺嘌呤和(hé)胞嘧啶未配對(duì)且可(kě)觸及的(de)堿基配對(duì)面甲基化(huà)。線粒體硫酸二甲酯突變分(fēn)析測序(mitochondrial DMS mutational profiling with sequencing, mitoDMS-MaPseq)是一種高(gāo)通(tōng)量、全基因組 RNA 結構探測策略,它利用(yòng)了(le)一種高(gāo)保真、進行性的(de)第二組反轉錄酶(thermostable group II reverse transcriptase, TGIRT),該酶可(kě)将 RNA 中的(de)硫酸二甲酯修飾轉化(huà)爲互補 DNA 中的(de)錯配。然後将 DMS 反應信息用(yòng)作基于熱(rè)力學的(de) RNA 折疊算(suàn)法的(de)約束條件,從而獲得(de)高(gāo)精度的(de)二級結構模型。
相關研究結果發表在2024年7月(yuè)19日的(de)Science期刊上,論文标題爲“The human mitochondrial mRNA structurome reveals mechanisms of gene expression”。
在建立了(le)可(kě)重複和(hé)準确的(de) mitoDMS-MaPseq 方法後,這(zhè)些作者研究了(le)功能性人(rén)類線粒體内的(de) mt-mRNA 結構。他(tā)們使用(yòng)了(le)從野生型細胞和(hé)缺乏LRPPRC蛋白的(de)細胞中分(fēn)離出來(lái)的(de)線粒體,其中LRPPRC 是 mt-mRNA 穩定性、多(duō)腺苷酸化(huà)和(hé)翻譯的(de)關鍵調節因子。他(tā)們的(de)比較分(fēn)析擴展到體外合成和(hé)折疊的(de)mt-mRNA。
他(tā)們的(de)研究結果闡明(míng)了(le) LRPPRC作爲一種保持酶(holdase)有助于維持 mt-mRNA 折疊和(hé)高(gāo)效翻譯。對(duì)野生型線粒體中mt-mRNA 結構的(de)深入認識和(hé)代謝标記揭示了(le)基因表達的(de)潛在機制。它們包括 mRNA 編程的(de)翻譯暫停,以支持 COX1(一種具有多(duō)個(gè)跨膜結構域的(de)疏水(shuǐ)性蛋白)的(de)合成,以及 mRNA 程序性核糖體和(hé)随後發生的(de)終止-再起始事件以協調雙順反子ATP8/6 轉錄本中兩個(gè) ORF 的(de)翻譯。此外,通(tōng)過使用(yòng)聚類算(suàn)法 DREEM(使用(yòng)期望最大(dà)化(huà)方法檢測 RNA 折疊結構),他(tā)們确定了(le)每個(gè)轉錄本所采用(yòng)的(de)共存替代構象,從而捕捉到了(le) mt-mRNA 折疊在結構集合體中的(de)動态性質。
綜上所述,這(zhè)些研究結果确定了(le) mt-mRNA 的(de)折疊圖譜,爲線粒體基因表達的(de)轉錄後調控提供了(le)新的(de)見解。此外,這(zhè)些作者還(hái)提出了(le)一種策略,可(kě)以研究不同細胞和(hé)組織中的(de) mt-mRNA 折疊及其在發育、疾病和(hé)衰老過程中調控線粒體基因表達的(de)作用(yòng)。

文章(zhāng)轉載自生物(wù)谷,系出于傳遞更多(duō)信息之目的(de),轉載内容不代表本站立場(chǎng)。如有侵權請及時(shí)聯系,我們将立即進行删除處理(lǐ)。



返回列表